Il 10 giugno 1521 tre fratelli notabili di Corbetta Onofrio, Antonio e Francesco Borri fondarono la Confraternita o Scuola della Madonna del Rosario, con lo scopo di promuovere il culto della Beata Vergine del Santo Rosario.

Nell’agosto 1630, anche a seguito degli avvenimento miracolosi che seguirono poi con la fondazione dell'omonimo stantuario, la confraternita deliberò l’acquisto di uno stendardo di pregevole valore artistico coll’effigie della Beata Vergine del Santo Rosario, da portare durante le processioni e come ringraziamento alla Madonna per l’improvvisa e quasi miracolosa cessazione della peste a Corbetta. Sempre nel medesimo periodo vennero definite le caratteristiche della divisa divisa, costituita da una veste bianca, da un cingolo blu e da una mantellina blu recante lo stemma in argento della Beata Vergine del Santo Rosario e di alcuni bastoni da portare durante le solennità da parte del Priore, del Vice Priore e del Cancelliere.

Nel corso dei secoli la confraternita divenne oggetto di numerose donazioni da parte di ricchi notabili come Roberto Borro e Lodovico Marliani che, rispettivamente negli anni 1568 e 1573, le donarono parte dei loro beni. La confraternita venne approvata dalle autorità ecclesiastiche nel 1902 quando il Priore in carica si rivolse al Rettore del Santuario, il quale ottenne, dal Cardinale Andrea Ferrari, Arcivescovo di Milano, un attestato ufficiale di approvazione. La confraternita ottenne inoltre di entrare a far parte dell'Arciconfraternita della Beata Vergine del Rosario, con sede storica a Roma nel 1903.

La confraternita ha ricevuto la benedizione del Cardinale Dionigi Tettamanzi in una sua visita al Santuario di Corbetta nel 2003, concedendo al priore in carica di officiare per altri 5 anni.

La confraternita della Beata Vergine del Santo Rosario ha sede nella chiesa superiore del Santuario della Beata Vergine dei Miracoli di Corbetta.